军团菌（Legionella）是一种兼性细胞内致病菌，普遍存在于天然淡水和人工水域（自来水、热水淋浴器、中央空调冷凝水、冷却塔水等）环境中，或在原生动物（如阿米巴虫）胞内寄生。目前已经确认的军团属有50种。其中，与人类疾病关系最为密切的是嗜肺军团菌种，已被发现有16种血清型。
军团菌，是一类广泛存在于自然界中的机会致病菌，目前已经发现30多种革兰氏阴性军团菌，不少都可以引发人感染，尤为最常见的是嗜肺军团菌，容易引发非典型性肺炎症状，如果不及时治疗，死亡率不低。
而之所以叫军团菌，是得名于1976年在美国费城召开退伍军人大会时爆发了这种流行病，当时在几年《独立宣言》签署200周年，然而却出现了这场流行病，导致221人患病，34人死亡，因此命名为军团菌。
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