一、聊城专署防疫队

新中国成立前，聊城专区无独立的卫生防疫机构。1947年1月始，聊城的卫生防疫工作由专署卫生科组织私人诊所医生实施。1949年，黑热病在聊城专区严重流行。10月，专署卫生科指示组建聊城专署黑热病防治队，这是聊城地区第一个专业性防疫队伍。防治队有6人组成，张连顺任队长，地址在聊城城内东白衣堂街路北。其主要工作任务是深入专署所辖县，进行黑热病普查普治。

1950年春，聊城专署黑热病防治队改称聊城专署防疫队。张连顺离职，苗佩文接任队长，唐义、张文裕任副队长，刘志洲任指导员。主要职责是应急扑灭疫情，开展流行病、地方病的调查研究及防治，组织地方中西医生进行预防接种、传染病报告及一般疫区处理。此后，人员设备进一步充实。至1953年，有职工32人（男25人、女7人），其中卫生技术人员28人，行政后勤人员4人。防疫队配有显微镜、高压消毒器、产科手术包等常用医疗器械及马车、自行车等简单交通工具。当年6月，防疫队撤销。

二、聊城专区（地区）卫生防疫站

1953年1月，政务院167次政务会议批准，卫生部于1954年10月20日颁发了（54）卫生秘字（203）号文件《卫生防疫站暂行办法》，并开始于全国重点县（市）设立卫生防疫站。

1956年7月，根据上级指示成立聊城专区卫生防疫站，下设卫生防疫股、地方病防治股、检验股、办公室。防疫站主要职责任务是：应急扑灭疫情，开展流行病、地方病的调查研究及防治，组织地方中西医生进行预防接种、传染病报告及一般疫区处理。防疫站共有职工28人，其中卫生技术人员20人，行政工勤人员8人。地址在聊城百货大楼（现金鼎购物中心），房舍48间，面积672平方米，全站占地面积6667平方米。

1959年，因建百货大楼，站址迁至闸口西路南原商业局招待所内，房舍30间，人员39人。

1961年，随区划调整，德州专区与聊城专区分开，部分人员调出，建立德州地区卫生防疫站。

1964年，站址由东关迁至育新街19号，占地6334平方米。是年，省卫生厅拨款5万元，建办公室325平方米，检验室475平方米，增添摩托车2辆、防疫汽车1辆，工作条件得到改善。

1966年，文化大革命开始，群众组织建立，并代行领导职权。1968年，成立革命委员会。1976年，文化大革命结束，工作逐步走向正规。

1978年8月为区级单位，1978年9月定为县级单位。当年，更名为聊城地区卫生防疫站。1979年，建1072平方米三层宿舍楼1幢。1984年8月定为副县级单位，1989年11月升格为县级单位。

1987年，建成3736平方米五层办公检验楼。至1985年底，全站共有职工102人，其中卫生技术人员83人，行政、工勤人员19人，设有办公室、卫生科、防疫科、食品卫生科、地方病科、检验科、宣教科、后勤科8个科室。

至1990年底，全站共有职工104人，其中卫生技术人员76人，内含副主任医（技）师7人，主管医（技）师23人，医师29（技）人，医（技）士12人，防疫（检验）员8人。行政工勤人员23人。设有办公室、卫生科、防疫科、食品卫生科、地方病防治科、检验科、宣教科、总务科8个科室，有汽车2部。检验科配备了荧光显微镜、色谱仪、分光光度计、低温冰箱和放免仪等较先进的仪器，总价值达50多万元。另有速冻器6台、幻灯机1台、投影仪1台、复印机1台及其他冷藏设备。是全区设备较先进、技术力量较雄厚、门类齐全的卫生防疫技术指导中心。

1993年12月，增设学校卫生科、劳动卫生科、放射卫生科、查体科、预防接种门诊、改革办公室。

1996年12月，增设卫生监督一科、二科、质量管理办公室、情报资料室、试剂部，地方病防治科更名为消杀科，撤消卫生科、改革办公室。

1997年12月，增设计划免疫科、疾病控制科，撤销情报资料室。

三、聊城市卫生防疫站

1998年3月，聊城撤地设市。同年12月，聊城地区防疫站改称聊城市卫生防疫站。站址在东昌府区育新街19号。主要职责：一是贯彻执行《中华人民共和国食品卫生法》、《中华人民共和国传染病防治法》、《中华人民共和国母婴保健法》等法律、法规和规定，并依法进行监督，履行行政监督职能。二是组织对重大疾病的综合防治；组织指导全区健康教育活动。三是组织协调全区公共卫生监督执法工作；负责食品、职业卫生、放射、学校、公共场所、饮水等的卫生监督管理工作；组织实施食品等与健康相关的质量管理，负责预防性体检、卫生检测等相关机构的资质考核认证工作。四是负责公共卫生行政执法案件听证、诉讼工作。

1998年4月，卫生局副局长徐坤兼任卫生防疫站党总支书记。

1998年8月，张子文任防疫站副站长。

1998年12月，增设卫生监督三科、四科。

2000年1月，增设卫生监督五科、行政保卫科、财务科、监察科，撤销总务科。

2001年1月，增设人事科、老干部科，撤销监察科。

2003年1月，增设慢病防治门诊，宣传教育科更名为健康教育科，撤销监督五科、老干部科。

至2003年11月，全站共有职工108人，其中卫生技术人员95人。其中本科学历15人，专科学历40人，中专学历39人；副高级职称12人，中级职称38人。设有办公室、人事科、财务科、行政保卫科、疾病控制科、计划免疫科、消杀科、健康教育科、劳动卫生科、学校卫生科、放射卫生科、检验科、查体科、卫生监督一～四科、预防接种门诊、慢病防治门诊等19个科室。有设备172台件，价值110万元。

2003年11月，经市编制委员会批准，在原市卫生防疫站的基础上组建聊城市疾病预防控制中心。

12月8日，市政府第8次常务会议研究确定并报经省计划委员会批准立项，在湖南路东首路南征地18亩新建聊城市疾病预防控制中心，总建筑面积9417平方米。

2004年12月，聊城市疾病预防控制中心在原聊城市卫生防疫站基础上更名成立。